El juego se desarrolla en un laboratorio secreto ubicado en el fondo del océano. Aquí, en la soledad vivía un científico excéntrico, experiencias y experimentos colegas le echan la culpa. Su tarea principal era crear un ser vivo dotado de razón y años después lo hizo. Pero al mismo tiempo, el creador desapareció en extrañas circunstancias, dejando Goo (este nombre ha recibido su descendencia) y esperar a que se perdiera. Héroe cansado de pasar un rato en un matraz de cámara y salir de ella, él fue en un viaje del complejo de encontrar rastros del amigo desaparecido. La capacidad de elegir el grado de elasticidad ayudará a superar varios obstáculos, para hacer frente al enemigo y de penetrar hasta donde el hombre común o cómo no consiguen.